Introducción:

Los estudios de asociación de genoma completo (GWAS) han identificado cientos de variantes genéticas asociadas a diabetes tipo 2 (DT2). No obstante, sólo explican una pequeña fracción de la heredabilidad estimada. Se ha propuesto que la heredabilidad perdida puede explicarse por interacciones entre loci (epistasis). El objetivo del presente trabajo es determinar si hay interacciones loci-loci propias de la población mexicana con DT2.

Metodología:

Se obtuvo ADN de sangre periférica de 350 sujetos con DT2 y 100 sujetos sin DT2. Las variantes genéticas rs9282541-ABCA1, rs4731702 y rs972283-KLF14, rs4720265- SFRP4, rs6467136 y rs10229583-PAX4 (previamente asociadas a DT2) se genotipificaron por medio de PCR- RT con sondas Taqman. El análisis de interacción entre variantes genéticas se realizó con el algoritmo de inducción constructiva de reducción de dimensionalidad multifactorial (MDR). Se excluyeron las variantes genéticas en desequilibrio de ligamiento o que no cumplieran con el equilibrio de Hardy- Weinberg. Se utilizaron pruebas de validación cruzada para identificar los mejores modelos, se consideró una p<0.05 como significativa.

Resultado(s):

El análisis de epistasis mostró dos interacciones loci-loci (p < 0.05). La primera entre rs9282541-ABCA1 y rs4720265-SFRP4. La segunda, entre las variantes: rs9282541-ABCA1, rs4731702-KLF14 y rs6467136-PAX4.

Conclusion(es):

El presente trabajo logró identificar dos interacciones loci-loci. Interesantemente en ambas interacciones la variante propia de la población Amerindia rs9282541-ABCA1 estuvo involucrada. Los resultados sugieren que existe epistasis entre variantes propias de la población mexicana que la hacen susceptible a padecer DT2.